TIANGEN mNGS樣本提取方案，助力精準(zhǔn)病原微生物檢測(cè)
背景：
分子診斷技術(shù)特別是病原宏基因組檢測(cè)技術(shù)（mNGS），在傳統(tǒng)病原體診斷、未知新發(fā)病原體鑒別、復(fù)合感染診斷、耐藥診斷、評(píng)估人體反應(yīng)和抗感染療效評(píng)價(jià)等方面具有良好應(yīng)用前景，為感染性疾病的防控提供了重要手段，也促進(jìn)了臨床診斷能力的提升。
mNGS可對(duì)患者樣品中的微生物和宿主遺傳物質(zhì)（DNA和RNA）進(jìn)行全面分析，并逐漸由實(shí)驗(yàn)室轉(zhuǎn)移至臨床應(yīng)用，作為醫(yī)生鑒別診斷的部分依據(jù)，為客觀診斷提供支持。臨床實(shí)驗(yàn)室中實(shí)施mNGS檢測(cè)，因其含有多種微生物信息，且不乏正常菌群、污染微生物及背景微生物，為*終結(jié)果的判讀帶來(lái)挑戰(zhàn)。而試劑盒中背景微生物的控制有助于背景微生物數(shù)據(jù)庫(kù)的建立，能有效助力mNGS結(jié)果的客觀判讀。
TIANGEN mNGS樣本提取方法：
TIANGEN mNGS樣本提取方案：
TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取試劑盒NG550，背景核酸有效防控的小量樣本病原核酸高效提取，助力精準(zhǔn)病原微生物檢測(cè)！
實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)：
使用5個(gè)批次的TIANGEN病原微生物提取試劑盒（S1-S5）及3款對(duì)照試劑盒（C1-C3）提取8 ng的模擬宿主（Arachis hypogaea）基因組DNA，取1 ng 所得DNA使用TIANSeq DirectFast Library Kit（NG101）構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)， illumina平臺(tái)Paired-End 150測(cè)序，每批試劑盒設(shè)置2個(gè)平行。所得數(shù)據(jù)經(jīng)質(zhì)控、過(guò)濾宿主序列后，進(jìn)行物種注釋。bowtie2比對(duì)病原數(shù)據(jù)庫(kù)，統(tǒng)計(jì)比對(duì)reads數(shù)量, 計(jì)算對(duì)應(yīng)RPM值。
1.有效的背景微生物核酸控制
圖1. 背景微生物核酸RPM值差異顯著性分析
計(jì)算5批次TIANGEN試劑盒提取建庫(kù)樣本（S1-S5）和3個(gè)對(duì)照試劑盒提取建庫(kù)樣本（C1-C3）中各種背景微生物RPM均值，采用非參數(shù)Wilcoxon檢驗(yàn)，P-value＜0.001，呈現(xiàn)極顯著差異。結(jié)果表明TIANGEN S1-S5樣本中PRM值顯著低于對(duì)照試劑盒C1-C3。
2. 良好的產(chǎn)品穩(wěn)定性
圖2. TIANGEN S1-S5樣本常見(jiàn)病原微生物RPM均值Wilcoxon檢驗(yàn)，采用非參數(shù)Wilcoxon檢驗(yàn)，對(duì)TIANGEN S1-S5樣本數(shù)據(jù)中12種潛在背景病原微生物RPM均值的差異顯著性檢驗(yàn)。結(jié)果顯示，S1-S5樣本間P-value＞0.05，無(wú)顯著差異。表明TIANGEN試劑盒在背景菌控制上表現(xiàn)出了良好的產(chǎn)品穩(wěn)定性。
圖3.常見(jiàn)背景病原微生物RPM均值比較
分析比較TIANGEN試劑盒所提取建庫(kù)的核酸樣本(S1-S5)和對(duì)照試劑盒所提取建庫(kù)的核酸樣本(C1-C3)中12種潛在背景病原微生物RPM均值。結(jié)果顯示,S1- S5中E. coli、 P.Aeruginosa、S. maltophilia較C1-C3組RPM均值降低。
TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取試劑盒（NG550）
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
本試劑盒采用具有獨(dú)特分離作用的磁珠和獨(dú)特的緩沖液系統(tǒng)，從血清、血漿、淋巴液、尿液、胸腹水、肺泡灌洗液、腦脊液、唾液、拭子、組織、糞便、痰液、無(wú)細(xì)胞體液、細(xì)胞培養(yǎng)上清液或各種病毒保存液中分離純化高質(zhì)量病原微生物DNA/RNA。獨(dú)特包埋的磁珠，在一定條件下對(duì)核酸具有很強(qiáng)的親和力，而當(dāng)條件改變時(shí)，磁珠釋放吸附的核酸，能夠達(dá)到快速分離純化核酸的目的。提取的DNA/RNA得率高、純度高、質(zhì)量穩(wěn)定可靠。使用本試劑盒純化的核酸可適用于各種常規(guī)操作，包括反轉(zhuǎn)錄、PCR、RT-PCR、熒光定量PCR、NGS等各種下游實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品特點(diǎn)
樣本廣泛：適用于血漿各種體液樣本、組織懸浮液、拭子等樣本。
共提?。?/span>可同時(shí)提取病原微生物的DNA和RNA
高效快速：1 h即可完成整個(gè)流程。
高通量：可整合磁棒法自動(dòng)化儀器或移液法自動(dòng)化儀器進(jìn)行高通量提取實(shí)驗(yàn)。
杭州沃森生物作為天根生化浙江企業(yè)代理商，為大家提供全線天根分子生物學(xué)產(chǎn)品及其他多樣化合作方式，如有需要，歡迎聯(lián)系：0571-86495259 訂購(gòu)信息： 產(chǎn)品名稱(chēng) 貨號(hào) 規(guī)格 TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取試劑盒 NG550 100次/盒 TIANMicrobe磁珠法大體積病原微生物DNA提取試劑盒 NG530 100次/盒 其他相關(guān)產(chǎn)品：
