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NGS技術專刊第五期—NGS測序**步就錯了?生物樣本保存運輸全攻略!
來源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時間: 2025-02-13 | 516 次瀏覽 | 分享到:

NGS技術??谖迤谏飿颖颈4?amp;運輸

拿到樣本后直接扔冰箱?運輸時只用泡沫箱加冰袋?這些操作可能讓你的NGS數(shù)據(jù)“翻車”!樣本保存和運輸是測序成功的**步,但80%的科研人都在這一步踩坑。本期NGS技術??晃闹v透血液、組織、核酸等樣本的正確處理姿勢!

為什么樣本保存運輸是NGS的“生死關”?

NGS技術雖強大,但“垃圾樣本進,垃圾數(shù)據(jù)出”!
常見翻車現(xiàn)場:

  • 血液樣本溶血導致游離DNA降解

  • 組織樣本反復凍融,RNA斷成“二維碼”

  • 微生物樣本常溫運輸,活菌變死菌
    ……

科學依據(jù):樣本中的核酸、蛋白質(zhì)或細胞活性對溫度、時間極度敏感,錯誤保存會直接導致:

  • 基因表達譜失真

  • 微生物多樣性數(shù)據(jù)偏差

  • 低頻突變檢出失敗

超全生物樣本保存&運輸指南

1、血液樣本

類型保存方式運輸保存期
全血(有核細胞)4℃EDTA抗凝管冰袋+4℃恒溫箱24h
血漿/血清分離后-80℃凍存(避免反復凍融)干冰運輸1年
游離DNA專用cfDNA保存管常溫7天

推薦:

LAKEbio游離DNA常溫保存管(有注冊證,貨號:3aB0310.0-100)

2、組織樣本

類型保存方式運輸
新鮮組織切割標本后置于樣本冷凍保存管中,液氮或者-80℃冰箱保存干冰運輸
FFPE樣本常溫保存,建議不超過半年置于固定液常溫運輸
冰凍切片-20℃不超過三個月,-80℃長期保存干冰運輸

3、核酸樣本(DNA/RNA)

類型保存濃度存儲溫度運輸
DNA≥50ng/μL-20℃短期冰袋
RNA≥200ng/μL-80℃長期干冰

推薦:

RNA樣本可添加RNA穩(wěn)定劑

長期儲存建議分裝至低吸附離心管

麥伯生物1.5ml低吸附離心管(貨號:MT-1.5-S-C-LR)

4、微生物樣本

類型需氧/厭氧保存液運輸
腸道菌群厭氧含甘油冷凍保護劑-80℃干冰
環(huán)境微生物需氧DNA/RNA Shield常溫

關鍵點:

活菌運輸需使用轉(zhuǎn)運培養(yǎng)基

16S擴增子測序樣本建議-80℃保存以防菌群比例變化

樣本是NGS的“生命之源”,一次正確的保存選擇,可能挽救價值百萬的科研數(shù)據(jù)!

溫馨Tips:

(1)樣本保存要注意標記清楚編號、樣本類型、處理日期、保存條件等。

(2)游離核酸血液樣本雖然是常溫運輸,但是面對極端天氣,要采取相應措施:冬季采血管可裝在保溫容器(例如保溫杯)中寄送,注意防撞;夏季,保溫容器先在4℃冰箱預冷,然后裝采血管寄送,注意防撞。

(3)FFPE樣本常溫運輸要注意高溫天氣,采取適當降溫措施。


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